生物信息服務
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層次聚類—Cluster
在文章中我們經??吹郊t綠相間,黃藍相間的圖,它的學名叫聚類圖,通俗點就是我們常說的熱點圖。它們不但美觀,且直觀闡述性強,在目前的高通量領域這個是必放的結果。 那此圖...
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散點圖—Scatter Plot
芯片或測序數據經過標準化處理后,在一個二維直角坐標系平面中,繪制散點圖。芯片數據的散點圖常用于評估兩組數據總體分布集中情況。散點圖中每一個點代表芯片上的探針點,該...
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火山圖——Volcano plot
芯片或測序數據經 T-Test 分析得到 P-value 值與 FC 值,兩個因素共同繪制火山圖( Volcano Plot ),用于顯示兩組樣數據的顯著性差異。橫軸代表探針的差異倍數( Fold chang ),縱軸代表探...
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功能的顯著性分析——GO Enrichment Analysis
Gene Ontology(GO)是基因功能國際標準分類體系。GO富集分析是對差異基因等按GO分類,并對分類結果進行基于離散分布的顯著性分析、錯判率分析、富集度分析,得到與實驗目的有顯著聯...
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通路的顯著性分析——Pathway Enrichment Analysis
目前,KEGG是有關Pathway的主要公共數據庫。根據挑選出的差異基因,計算這些差異基因同Pathway 的超幾何分布關系,Pathway 分析會對每個有差異基因存在的pathway 返回一個p-value,小的p 值...
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