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            新聞中心

            中康博生物重磅推出單細胞轉錄組測序服務!

            來源:小博發布時間:2018-06-06

            Chromium™系統-單細胞轉錄組測序服務

            單細胞轉錄組測序(Single cell RNA sequencing)是在單個細胞水平對mRNA進行高通量測序的一項新技術,除了對單個細胞進行信息挖掘外,也可利用自動化平臺來完成細胞圖譜的繪制,實現大量細胞的分群。在眾多平臺中,10x Genomics ChromiumTM平臺可謂是自動化完成大規模單細胞研究中的佼佼者,其技術核心是含有75萬種Barcode的油滴包裹的凝膠珠(GEM)。2018年至今,利用該平臺研究單細胞轉錄組就已發表30余篇文章,囊括了Cell、Nature、Science等國際刊物。中康博生物現推出基于ChromiumTM_10X系統平臺的單細胞轉錄組測序服務!

            項目流程

            1. 細胞濃度500-2000個/μl;體積>200μl;細胞總數>10^5。
            2. 細胞不成團,少碎片,存活率>90%,無逆轉錄抑制劑。
            3. 在10分鐘內自動完成多至80,000個細胞的捕獲;GEM形成后,細胞裂解,凝膠珠釋放Barcode序列;mRNA逆轉錄產生帶有Barcode和UMI信息的cDNA;以cDNA為模板進行PCR擴增,建庫、測序。
            4. 數據分析,此時Barcode標記細胞,UMI標記轉錄本并用于后續定量。
             
            項目優勢

            樣品收集Easy!Fast?。杭毎麘乙簶颖炯粗萍慈?,無需凍存,專人現場完成細胞計數;
            檢測通量High:一次性可完成500–10000個單細胞的表達譜檢測,110G/Lane;
            檢測平臺New:10 X Genomics或NovaSeq;
            捕獲效率High:10min內處理100-80,000個細胞,細胞捕獲率高達65%;
            平臺兼容High:與Illumina測序平臺高度兼容(HiSeq4000/2500/NextSeq/MiSeq)
             
            項目分析



            部分結果展示:

            左:有效細胞評估圖及測序飽和曲線圖
            中:細胞分群圖(不同顏色代表不同亞群,右側圖例為亞群名稱與對應的亞群顏色)
            右:細胞分群相關性圖(Color Key由pearson相關系數確定,顏色越深,亞群相關性越大)

            左:細胞亞群top20基因聚類熱圖(每列為1個基因,每行為1個Cluster)
            右:細胞亞群top20基因表達熱圖(首圖不同顏色代表不同cluster的細胞;其它圖為某一亞群的top20基因在所有細胞中的表達熱圖)
             
            樣品要求:細胞濃度500-2000個/μl;體積>200μl;細胞總數>10^5。

            取樣事宜:提前溝通取樣時間,客戶當天制備細胞懸液后,無需凍存,當天公司有專人帶儀器過去取樣,現場進行細胞計數,若樣本合格即時取回。
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